El registro y autorización de productos farmacéuticos de uso exclusivamente veterinario es atribución del Servicio Agrícola y Ganadero (SAG), no obstante, mediante un convenio de cooperación Interinstitucional, Sernapesca se pronuncia respecto a las solicitudes presentadas, en particular sobre la pertinencia epidemiológica de los productos farmacéuticos veterinarios de uso acuícola. Además, Sernapesca apoya al SAG en otras materias técnicas que le sean requeridas.

El uso en la acuicultura de productos farmacéuticos veterinarios se encuentra regulado a través del Reglamento de Medidas de Protección Control y Erradicación de Enfermedades de Alto Riesgo para las Especies Hidrobiológicas, D.S. N°319/2001, y de los Programas Sanitarios Generales de Manejo de Enfermedades, Manejo de Alimentos y de Vacunaciones que se desprenden del mismo.

De acuerdo a lo establecido en dicho reglamento las empresas de cultivo deben informar los tratamientos terapéuticos y profilácticos realizados en los centros de cultivo, para lo cual el Servicio ha dispuesto una planilla de reporte que debe ser enviada mensualmente al correo electrónico Esta dirección electrónica esta protegida contra spam bots. Necesita activar JavaScript para visualizarla .

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Por otra parte, Sernapesca posee un Programa de Control de Residuos de Productos Farmacéuticos, Contaminantes y Sustancias Prohibidas, que tiene por objetivo garantizar la inocuidad de los productos elaborados en base a peces de cultivo.